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低溫電鏡解析蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)展

更新日期:2016-04-05      點(diǎn)擊次數(shù):3388

  結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域有一條不成文的觀點(diǎn):結(jié)構(gòu)決定功能。只有知道生物分子的原子排布,科學(xué)家們才能了解這個(gè)蛋白的功能。幾十年來(lái),分析蛋白結(jié)構(gòu)有一個(gè)無(wú)冕*——X射線晶體衍射。在X射線晶體衍射中,科學(xué)家們讓蛋白結(jié)晶,然后利用X射線照射,隨后根據(jù)X射線的衍射來(lái)重建蛋白的結(jié)構(gòu)。在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)銀行(Protein Data Bank)的100000多條蛋白詞目里,超過(guò)90%的蛋白結(jié)構(gòu)是利用X射線晶體衍射技術(shù)解析得到的。

  盡管X射線晶體衍射一直是結(jié)構(gòu)生物學(xué)家的*工具,但是它存在較大的限制??茖W(xué)家們將蛋白進(jìn)行大塊結(jié)晶通常需要多年的時(shí)間。而很多基礎(chǔ)蛋白分子,例如嵌在細(xì)胞膜上的蛋白,或是形成復(fù)合體的蛋白卻無(wú)法被結(jié)晶。

  X射線晶體衍射技術(shù)(X-ray crystallography)即將成為歷史,低溫電子顯微技術(shù)(cryo-electron microscopy, 也稱作electron cryomicroscopy, cryo-EM)引發(fā)結(jié)構(gòu)生物學(xué)變革。

  低溫電子顯微鏡適用于研究大的、穩(wěn)定的分子,這些分子能夠承受電子的轟擊,而不發(fā)生變形——由多個(gè)蛋白組成的分子機(jī)器是的樣本。因此由RNA緊緊圍繞的核糖體是*的樣本。三位化學(xué)家用X射線晶體衍射研究核糖體溶液的工作在2009年獲得了諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),但這些工作花了幾十年。近幾年,低溫電鏡研究者們也陷入了“核糖體熱”。多個(gè)團(tuán)隊(duì)研究了多種生物的核糖體,包括人類核糖體的*高清模型。X射線晶體衍射的研究成果遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于LMB的Venki Ramakrishnan實(shí)驗(yàn)室,Venki獲得了2009年的諾獎(jiǎng)。Venki表示,對(duì)于大分子來(lái)說(shuō),低溫電子顯微鏡遠(yuǎn)比X射線晶體衍射要實(shí)用。

  這幾年,低溫電子顯微鏡的相關(guān)文章有很多:2015年一年,這個(gè)技術(shù)就用于100多個(gè)分子的結(jié)構(gòu)研究。X-射線晶體衍射只能對(duì)單個(gè)、靜態(tài)的蛋白晶體成像,但低溫電子顯微鏡能夠?qū)Φ鞍椎亩喾N構(gòu)象進(jìn)行成像,幫助科學(xué)家們推斷蛋白的功能。

  現(xiàn)在低溫電鏡迅猛發(fā)展,專家們正在尋找更大的挑戰(zhàn)作為下一個(gè)解析目標(biāo)。對(duì)很多人來(lái)說(shuō),zui想解析的是夾在細(xì)胞膜內(nèi)的蛋白。這些蛋白是細(xì)胞信號(hào)通路中的關(guān)鍵分子,也是比較熱門的藥物靶標(biāo)。這些蛋白很難結(jié)晶,而低溫電子顯微鏡不大可能對(duì)單個(gè)蛋白進(jìn)行成像,這是因?yàn)楹茈y從背景噪音中提取這些信號(hào)。

  這些困難都無(wú)法阻擋加利福利亞大學(xué)(University of California)的生物物理學(xué)家程亦凡。他計(jì)劃解析一種細(xì)小的膜蛋白TRPV1。TRPV1是檢測(cè)辣椒中引起灼燒感的物質(zhì)的受體,并與其它痛感蛋白緊密相關(guān)。加利福利亞大學(xué)病理學(xué)家David Julius等人之前嘗試結(jié)晶TRPV1,結(jié)果失敗。用低溫電子顯微鏡解析TRPV1項(xiàng)目,一開始進(jìn)展緩慢。但2013年底,技術(shù)進(jìn)步使得這一項(xiàng)目有了重大突破,他們獲得了分辨率為0.34納米的TRPV1蛋白的結(jié)構(gòu)。該成果的發(fā)表對(duì)于領(lǐng)域來(lái)說(shuō),無(wú)異于驚雷。因?yàn)檫@證實(shí)了低溫電子顯微鏡能夠解析小的、重要的分子。

  盡管低溫電子顯微鏡發(fā)展迅速,很多研究者認(rèn)為,它仍有巨大提升空間。他們希望能制造出更靈敏的電子探測(cè)器,以及更好地制備蛋白樣本的方法。這樣的話,就能夠?qū)Ω〉摹⒏鼊?dòng)態(tài)的分子進(jìn)行成像,并且分辨率更高。5月,有研究者發(fā)表了一篇細(xì)菌蛋白的結(jié)構(gòu),分辨率達(dá)到了0.22納米。這也顯示了低溫顯微鏡的潛力。

  1997年時(shí),英國(guó)醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Richard Henderson非常堅(jiān)定地宣稱,低溫電鏡會(huì)成為解析蛋白結(jié)構(gòu)的主流工具。在將近20年后的今天,他的預(yù)測(cè)比當(dāng)年有了更多底氣。Henderson表示,如果低溫電鏡保持這樣的勢(shì)頭繼續(xù)發(fā)展,技術(shù)問(wèn)題也得以解決,那么低溫電鏡不僅會(huì)成為解析蛋白結(jié)構(gòu)的*選擇,而是主流選擇。這個(gè)目標(biāo)已經(jīng)離我們不遠(yuǎn)了。

  1. 施一公小組在《Science》發(fā)兩篇論文報(bào)道剪接體三維結(jié)構(gòu)

低溫電鏡解析蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)展

  U4/U6.U5 tri-snRNP電鏡密度及三維結(jié)構(gòu)示意圖。

  2015年8月21日,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院施一公教授研究組在*期刊《科學(xué)》(Science)同時(shí)在線發(fā)表了兩篇背靠背研究長(zhǎng)文,題目分別為“3.6埃的酵母剪接體結(jié)構(gòu)”(Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution)和“前體信使RNA剪接的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)”(Structural Basis of Pre-mRNA Splicing)。*篇文章報(bào)道了通過(guò)單顆粒冷凍電子顯微技術(shù)(冷凍電鏡)解析的酵母剪接體近原子分辨率的三維結(jié)構(gòu),第二篇文章在此結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)行了詳細(xì)分析,闡述了剪接體對(duì)前體信使RNA執(zhí)行剪接的基本工作機(jī)理。清華大學(xué)生命學(xué)院博士后閆創(chuàng)業(yè)、醫(yī)學(xué)院博士研究生杭婧和萬(wàn)蕊雪為兩篇文章的共同*作者。

  這一研究成果具有極為重大的意義。自上世紀(jì)70年代后期RNA剪接的發(fā)現(xiàn)以來(lái),科學(xué)家們一直在步履維艱地探索其中的分子奧秘,期待早日揭示這個(gè)復(fù)雜過(guò)程的分子機(jī)理。施一公院士研究組對(duì)剪接體近原子分辨率結(jié)構(gòu)的解析,不僅初步解答了這一基礎(chǔ)生命科學(xué)領(lǐng)域長(zhǎng)期以來(lái)備受關(guān)注的核心問(wèn)題,又為進(jìn)一步揭示與剪接體相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)理提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)。詳細(xì)新聞報(bào)道參見(jiàn):施一公研究組在《科學(xué)》發(fā)表論文報(bào)道剪接體組裝過(guò)程重要復(fù)合物U4/U6.U5 tri-snRNP的三維結(jié)構(gòu)。(Science, 20 Aug 2015, doi: 10.1126/science.aac7629; doi: 10.1126/science.aac8159)

  2. Science:HIV重大突破!*zui詳細(xì)HIV包膜三維結(jié)構(gòu)出爐!

低溫電鏡解析蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)展

  這項(xiàng)研究解析出HIV Env三聚體處于自然狀態(tài)下的高分辨率結(jié)構(gòu)圖,其中HIV利用Env三聚體侵入宿主細(xì)胞。圖片來(lái)自The Scripps Research Institute。

  在一項(xiàng)新的研究中,TSRI的研究人員解析出負(fù)責(zé)識(shí)別和感染宿主細(xì)胞的HIV蛋白的高分辨率結(jié)構(gòu)圖片。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2016年3月4日那期Science期刊上,論文標(biāo)題為“Cryo-EM structure of a native, fully glycosylated, cleaved HIV-1 envelope trimer”。

  這項(xiàng)研究是解析出這種被稱作包膜糖蛋白三聚體(envelope glycoprotein trimer,以下稱Env三聚體)的HIV蛋白處于自然狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)圖。這些也包括詳細(xì)地繪制這種蛋白底部的脆弱位點(diǎn)圖,以及能夠中和HIV的抗體結(jié)合位點(diǎn)圖。(Science, 04 Mar 2016, doi: 10.1126/science.aad2450)

  3. Nature:*zui詳細(xì)轉(zhuǎn)錄因子TFIID三維結(jié)構(gòu)出爐,力助揭示人類基因表達(dá)秘密

  在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)加州大學(xué)伯克利分校、勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室和西班牙國(guó)家研究委員會(huì)(CSIC)羅卡索拉諾物理化學(xué)研究所的研究人員在理解我們體內(nèi)被稱作轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物(pre-initiation complex, PIC)的分子機(jī)構(gòu)(molecular machinery)如何發(fā)現(xiàn)合適的DNA片段進(jìn)行轉(zhuǎn)錄方面取得重大進(jìn)展。他們*地詳細(xì)呈現(xiàn)一種被稱作TFIID的轉(zhuǎn)錄因子所發(fā)揮的作用。相關(guān)研究結(jié)果于2016年3月23日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Structure of promoter-bound TFIID and model of human pre-initiation complex assembly”。論文通信作者是勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室生物物理學(xué)家Eva Nogales,論文*作者是Nogales實(shí)驗(yàn)室生物物理學(xué)研究生Robert Louder。其他作者是Yuan He、José Ramón López-Blanco、Jie Fang和Pablo Chacón。

  這一發(fā)現(xiàn)是非常重要的,這是因?yàn)樗鼮榭茖W(xué)家們理解和治療一系列惡性腫瘤鋪平道路。Eva Nogales說(shuō),“理解細(xì)胞中的這種調(diào)節(jié)過(guò)程是操縱它或當(dāng)它變壞時(shí)修復(fù)它的*方式?;虮磉_(dá)是包括從胚胎發(fā)育到癌癥在內(nèi)的很多重要生物學(xué)過(guò)程的關(guān)鍵。一旦我們能夠操縱這些基本機(jī)制,那么我們就能夠要么校正應(yīng)當(dāng)或不應(yīng)當(dāng)存在的基因表達(dá),要么阻止這種過(guò)程[即基因表達(dá)]失去控制時(shí)的惡性狀態(tài)。”(Nature, 31 March 2016, doi:10.1038/nature17394)

  4. Science:科學(xué)家成功解析人類剪接體關(guān)鍵結(jié)構(gòu)

低溫電鏡解析蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)展

  在zui近發(fā)表的一篇Science研究論文中,來(lái)自德國(guó)的科學(xué)家們利用冷凍電鏡技術(shù)在分子級(jí)分辨率水平上重現(xiàn)了人類剪接體中一個(gè)關(guān)鍵復(fù)合體——U4/U6.U5 tri-snRNP的結(jié)構(gòu)。剪接體是一種由RNA和蛋白質(zhì)組成的用于切掉mRNA前體中內(nèi)含子的分子機(jī)器。該研究解析的U4/U6.U5 tri-snRNP是構(gòu)成剪接體的一個(gè)重要組成部分,研究人員利用單顆粒冷凍電鏡獲得了人類U4/U6.U5 tri-snRNP的三維結(jié)構(gòu),該復(fù)合體分子量達(dá)到180萬(wàn)道爾頓,解析分辨率達(dá)到7埃。該研究模型揭示了Brr2 RNA解螺旋酶如何在分離的人類tri-snRNP中通過(guò)空間結(jié)構(gòu)阻止未成熟的U4/U6 RNA發(fā)生解鏈,還展現(xiàn)了泛素C端水解酶樣蛋白Sad1如何將Brr2固定在預(yù)激活位置。

  研究人員將他們獲得的結(jié)構(gòu)模型與釀酒酵母tri-snRNP以及裂殖酵母剪接體的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了對(duì)比,結(jié)果表明Brr2在剪接體激活過(guò)程中發(fā)生了顯著的構(gòu)象變化,支架蛋白Prp8也發(fā)生了結(jié)構(gòu)變化以容納剪接體的催化RNA網(wǎng)絡(luò)。(Science, 25 Mar 2016, doi: 10.1126/science.aad2085)

  5. 北京大學(xué)毛有東、歐陽(yáng)頎課題組與其合作者在Science發(fā)表炎癥復(fù)合體冷凍電鏡結(jié)構(gòu)

  炎癥復(fù)合體三維結(jié)構(gòu)

  北京大學(xué)物理學(xué)院毛有東研究員、北京大學(xué)物理學(xué)院/定量生物學(xué)中心歐陽(yáng)頎院士與哈佛醫(yī)學(xué)院吳皓教授合作利用冷凍電子顯微鏡技術(shù)解析了近原子分辨率的炎癥復(fù)合體的三維結(jié)構(gòu),闡釋了其復(fù)合物在免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中的單向多聚活化的分子結(jié)構(gòu)機(jī)理。該研究工作以“Cryo-EM Structure of the Activated NAIP2/NLRC4 Inflammasome Reveals Nucleated Polymerization”為題于2015年10月8日在線發(fā)表在期刊Science。

  先天免疫是人類免疫系統(tǒng)的重要組成部分,炎癥復(fù)合體在觸發(fā)先天免疫響應(yīng)的過(guò)程中起到了關(guān)鍵信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的效應(yīng)器作用,從而啟動(dòng)細(xì)胞凋亡等免疫應(yīng)答和炎癥反應(yīng)。炎癥復(fù)合體是胞漿內(nèi)一組復(fù)雜的多蛋白復(fù)合體,是胱天蛋白酶活化所必需的反應(yīng)平臺(tái),其復(fù)合物單體由多個(gè)結(jié)構(gòu)域構(gòu)成,并在上游蛋白的激活下誘導(dǎo)組裝形成環(huán)狀復(fù)合物。炎癥復(fù)合體的結(jié)構(gòu)對(duì)于認(rèn)識(shí)先天免疫的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程、免疫調(diào)控和病原誘導(dǎo)活化等免疫響應(yīng)機(jī)理具有關(guān)鍵的核心價(jià)值,因而成為國(guó)內(nèi)外*結(jié)構(gòu)生物學(xué)和免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室追捧的研究對(duì)象。(Science, 23 Oct 2015, 10.1126/science.aac5789)

  6. Nature:施一公團(tuán)隊(duì)揭示γ-分泌酶原子分辨率結(jié)構(gòu)

  人體γ-分泌酶3.4埃三維結(jié)構(gòu)

  日前,清華大學(xué)教授施一公團(tuán)隊(duì)與國(guó)外學(xué)者合作,構(gòu)建了分辨率高達(dá)3.4埃的人體γ-分泌酶的電鏡結(jié)構(gòu),并且基于結(jié)構(gòu)分析了γ-分泌酶致病突變體的功能,為理解γ-分泌酶的工作機(jī)制以及阿爾茨海默氏癥的發(fā)病機(jī)理提供了重要基礎(chǔ)。相關(guān)成果8月18日在《自然》發(fā)表。

  阿爾茨海默氏癥是zui為嚴(yán)峻的老年神經(jīng)退行性疾病之一,但其發(fā)病機(jī)理尚待揭示。目前研究已知β-淀粉樣沉淀是該病的標(biāo)志性癥狀之一。而β-淀粉樣沉淀的產(chǎn)生是APP蛋白經(jīng)過(guò)一系列蛋白酶切割產(chǎn)生的短肽聚集而來(lái)。在此切割過(guò)程中,zui關(guān)鍵的蛋白酶是γ-分泌酶。γ-分泌酶由四個(gè)跨膜蛋白亞基組成,其中,編碼Presenilin(PS1)蛋白的基因中有200多個(gè)突變與阿爾茨海默氏癥病人相關(guān)。γ-分泌酶在阿爾茨海默氏癥的發(fā)病中扮演著重要角色。

  研究人員通過(guò)收集更多的數(shù)據(jù)、大量的計(jì)算并升級(jí)分類方法,計(jì)算構(gòu)建出3.4埃原子分辨率γ-分泌酶的三維結(jié)構(gòu),可以觀察到絕大部分氨基酸的側(cè)鏈以及胞外區(qū)部分糖基化修飾和結(jié)合的脂類分子。在高分辨結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,施一公研究組對(duì)PS1上的致病性突變體進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)這些突變主要集中在兩個(gè)較為集中的區(qū)域內(nèi)。他們對(duì)于其中一些突變體進(jìn)行了生化性質(zhì)的研究,發(fā)現(xiàn)這些突變會(huì)影響γ-分泌酶對(duì)于底物APP的酶切活性,然而對(duì)切割活性的影響卻有所不同。(Nature, 10 September 2015, doi:10.1038/nature14892)

  7. Nature:人類核糖體結(jié)構(gòu)終于被解析!

  核糖體是進(jìn)行蛋白質(zhì)翻譯的機(jī)器,能夠催化蛋白質(zhì)合成。目前,許多研究已經(jīng)對(duì)多種生物的核糖體結(jié)構(gòu)進(jìn)行了原子水平的結(jié)構(gòu)解析,但獲得人核糖體結(jié)構(gòu)一直存在很大挑戰(zhàn),這一問(wèn)題的解決對(duì)于人類疾病的深入了解以及治療手段和策略的開發(fā)都有重要意義。

  近日,學(xué)術(shù)期刊nature在線發(fā)表了法國(guó)科學(xué)家關(guān)于人類核糖體結(jié)構(gòu)解析的研究進(jìn)展。

  在該項(xiàng)研究中,研究人員利用高分辨率單顆粒低溫電子顯微鏡以及原子模型構(gòu)建的方法獲得了人類核糖體接近原子水平的結(jié)構(gòu)。該核糖體結(jié)構(gòu)的平均分辨率為3.6A,接近zui穩(wěn)定區(qū)域的2.9A分辨率水平。這一研究成果對(duì)人類核糖體RNA,氨基酸側(cè)鏈的實(shí)體結(jié)構(gòu),特別是轉(zhuǎn)運(yùn)RNA結(jié)合位點(diǎn)以及tRNA脫離位點(diǎn)處的特定分子相互作用提供了深入見(jiàn)解,揭示了核糖體大小亞基接觸面的原子細(xì)節(jié),發(fā)現(xiàn)在核糖體大小亞基的旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)過(guò)程中,其接觸面發(fā)生了強(qiáng)烈的重構(gòu)過(guò)程。(Nature, 30 April 2015, doi:10.1038/nature14427)

  8. Nature:日本科學(xué)家成功解析代謝關(guān)鍵因子受體結(jié)構(gòu)

  近日,學(xué)術(shù)期刊nature在線發(fā)表了日本科學(xué)家的研究進(jìn)展,他們利用結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法對(duì)脂聯(lián)素(adiponectin)受體,AdipoR1和AdipoR2,進(jìn)行了結(jié)構(gòu)解析,發(fā)現(xiàn)脂聯(lián)素受體具有與G蛋白偶聯(lián)受體不同的七次跨膜螺旋,對(duì)于靶向脂聯(lián)素受體的肥胖及其相關(guān)代謝疾病治療方法開發(fā)具有重要意義。

  在該項(xiàng)研究中,研究人員對(duì)人類AdipoR1和AdipoR2的晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行了解析,分辨率分別達(dá)到2.9 ?和2.4 ?,他們通過(guò)解析發(fā)現(xiàn)脂聯(lián)素受體是具有不同結(jié)構(gòu)的一類新受體。脂聯(lián)素受體的這種七次跨膜螺旋在構(gòu)象上與G蛋白偶聯(lián)受體的七次跨膜螺旋不同,在這種新的 七次跨膜螺旋中,由三個(gè)保守組氨酸殘基協(xié)同一個(gè)鋅離子形成了一個(gè)大的腔體。這種鋅結(jié)合結(jié)構(gòu)可能在adiponectin刺激的AMPK磷酸化和UCP2表達(dá)上調(diào)方面具有一定作用。(Nature, 16 April 2015, doi:10.1038/nature14301 )

  9. Molecular Cell:中國(guó)科學(xué)家揭示A型流感病毒RNA聚合酶復(fù)合體的三維冷凍電鏡結(jié)構(gòu)

  2015年1月22日,中科院生物物理所劉迎芳研究組與清華大學(xué)王宏偉研究組在期刊Molecular Cell雜志在線發(fā)表了題目為 “Cryo-EM Structure of Influenza Virus RNA Polymerase Complex at 4.3 ? Resolution”的論文,揭示了流感病毒RNA聚合酶復(fù)合體的結(jié)構(gòu)和功能。

  生物物理所劉迎芳和清華大學(xué)王宏偉課題組等中外多方參與的實(shí)驗(yàn)室通過(guò)使用的高分辨率單顆粒冷凍電鏡三維重構(gòu)技術(shù),解析了含有A型流感病毒RNA聚合酶大部分成分的4.3埃分辨率的四聚體電鏡結(jié)構(gòu)。該復(fù)合體涵蓋了流感病毒聚合酶催化活性的核心區(qū)域。從三維重構(gòu)密度圖中可以清晰識(shí)別出該空腔內(nèi)PB1上的催化結(jié)構(gòu)域以及結(jié)合的RNA復(fù)制起始鏈,據(jù)此,研究人員推測(cè)這是進(jìn)行RNA合成反應(yīng)的區(qū)域。這一活性中心結(jié)構(gòu)與正鏈RNA聚合酶具有相似性,研究人員也因此提出了流感病毒合成新生RNA鏈的機(jī)制。(Molecular Cell, 5 March 2015, doi:10.1016/j.molcel.2014.12.031)

  10. Cell:科學(xué)家獲得*中介體復(fù)合物結(jié)構(gòu)圖

  中介體復(fù)合物(Mediator Complex)是細(xì)胞中zui大也zui為復(fù)雜的分子機(jī)器之一。現(xiàn)在,來(lái)自斯克利普斯研究所(TSRI)的科學(xué)家們?cè)凇都?xì)胞》雜志上報(bào)告稱,他們利用用電鏡獲得了*中介體復(fù)合物(Mediator)的結(jié)構(gòu)圖。

  Mediator是所有動(dòng)植物細(xì)胞中的關(guān)鍵分子機(jī)器,對(duì)于絕大多數(shù)基因的轉(zhuǎn)錄有著至關(guān)重要的調(diào)控作用。Mediator擁有二十多個(gè)蛋白亞基,解析它的結(jié)構(gòu)是基礎(chǔ)細(xì)胞生物學(xué)的一大進(jìn)步。這一成果能夠?yàn)樵S多疾病提供寶貴的線索(從癌癥到遺傳性的發(fā)育疾病)。論文資深作者,TSRI副教授Francisco Asturias表示:"明確這些大分子機(jī)器的結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制,可以幫助我們理解許多關(guān)鍵的細(xì)胞過(guò)程。"

  在這項(xiàng)新研究中,研究人員獲得了高純度的酵母Mediator,并通過(guò)電鏡成像得到了迄今為止zui為清晰的Mediator3D模型,分辨率達(dá)到約18埃。隨后他們又進(jìn)行了多種生化分析,例如在逐個(gè)去除蛋白亞基的同時(shí)觀察電鏡圖像發(fā)生的改變。他們由此確定了酵母Mediator25個(gè)蛋白亞基的定位。

  項(xiàng)新研究獲得的結(jié)構(gòu)圖譜,全面修正了之前的Mediator'粗略模型。論文*作者Kuang-LeiTsai表示:"定位了所有的蛋白亞基之后,我們發(fā)現(xiàn)頭部模塊應(yīng)該位于Mediator的頂部而不是底部。"此外,研究人員還對(duì)人類Mediator進(jìn)行了深入研究。Tsai說(shuō):"大體上看,人類和酵母的Mediator總體結(jié)構(gòu)頗為類似。"zui后研究人員在結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,為人們展示了Mediator調(diào)控轉(zhuǎn)錄時(shí)的構(gòu)象變化。

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